El COMAFP cuenta con dos salas, cada una de ellas conformada por seis (6) médicos miembros, cuatro (4) designados por las AFP y dos (2) por la SBS.
En las sesiones de las salas donde se estudian los casos participa además un secretario médico y un médico observador de las compañías de seguros, quienes tienen derecho a opinión mas no a voto.
